Os tubarões estão classificados em oito ordens diferentes, de acordo com as características físicas comuns que agrupam as espécies.
Embora isto pareça relativamente simples, não é fácil classificar tubarões, pois as características usadas para defini-los nem sempre são fáceis de identificar.
Algumas das características usadas para diferenciar os tubarões incluem: o número de fendas branquiais, o número e tipo de barbatanas, a presença de uma membrana por cima do olho, o tipo de reprodução e até a estrutura de válvulas nos intestinos.
Como resultado disso, duas espécies semelhantes podem ser membros de ordens totalmente diferentes, como por exemplo o tubarão-mako e o tubarão-azul; enquanto outras duas bem diferentes podem ser membros da mesma ordem, como é o caso do tubarão-prego e do tubarão-martelo, que pertencem à ordem dos Carcharhiniformes.
Classificar tubarões é tão complicado que nem mesmo os especialistas conseguem chegar a um acordo ao determinar a espécie de um exemplar .
Alguns estudiosos colocam o tubarão-cobra, do qual só existe uma espécie conhecida, numa ordem separada dos outros e denominada Chlamydoselachiformes.
Entretanto, há quem coloque os membros de um grupo apelidado de tubarões-prego - e cujas duas espécies a maioria dos taxinomistas coloca nos Squaliformes - na sua própria ordem dos Echinorhiniformes.
As oito ordens de tubarões, segundo o seu mais fácil reconhecimento, são:
Heterodontiformes: Tubarões Bullhead: contendo um só gene e distribuídos por apenas 10 espécies.
Orectolobiformes: Tubarões Carpet: 34 espécies, incluindo o Tubarão-Baleia, o Tubarão-lixa e o Tubarão-Zebra.
Lamniformes: Tubarões Mackerel: 16 espécies, incluindo alguns bem conhecidos, como o grande Tubarão-Branco e o Tubarão-Mako.
Carcharhiniformes: Tubarões ground. O grupo mais complexo, com mais de 270 espécies, incluindo Tigres, Martelo e Tubarão-Negro.
Hexanchiformes: Tubarões-vaca: 4 espécies, com seis ou sete fendas branquiais.
Squaliformes: Cações: Cerca de 115 espécies conhecidas, incluindo Arreganhadas, Pata-roxas e Lixinhas-da-fundura.
Squatiniformes: Tubarões-Anjo: Cerca de 18 espécies, todos com uma forma de corpo distintivamente achatada.
Pristiophoriformes: Tubarões-Serra: 8 espécies, todos com um focinho em forma de serra.

O Tubarão-de-pontas-negras dos recifes
pertence ao mais complexo grupo de tubarões,
os Carchariniformes, ou tubarões dos fundos.
Fonte: www.discoverybrasil.com